5月20日下午，学院学习实践活动由第一阶段学习调研转入第二阶段分析检查动员大会在学术报告厅隆重召开，大会就前一阶段学习调研和解放思想大讨论活动的开展情况进行了总结回顾，对第二阶段的工作进行了具体部署。院领导胡秋林、张永生、韩光辉、马莉莉、袁益强出席大会，全体党员参加了大会。
院学习实践活动领导小组组长、党委书记胡秋林在动员大会上发表重要讲话，他指出，学院学习实践活动自3月20日启动以来，按照省教育工委的部署和要求，在省属高校第二指导检查组的悉心指导下，坚持高标准、高质量，各级党组织不折不扣、扎扎实实做好每项工作，广大党员特别是党员领导干部积极行动、认真参与，做到了领导重视、准备充分、开局良好、进展顺利，取得了初步成效。学院和各党总支（直属支部）先后组织召开各类座谈会20余次，院领导牵头成立专题调研组5个，召开专题辅导报告会4场，组织中心组学习会4次，组织开展专题调研座谈15次，发放并收回《教职工问卷》、《学生问卷》1000余份，梳理意见建议30余条，编写简报21期，学习实践活动专题网站和校报专栏发稿60余篇，新安晚报、蚌埠日报、蚌埠电视台、蚌埠人民广播电台采访报道累计达10余次。总的来看，第一阶段各环节的工作是比较扎实的，学习调研的成效也是比较明显的。
胡秋林在动员报告中指出，根据省教育工委的安排，分析检查阶段整体时间安排7周左右，从5月上旬开始，到7月上旬结束，主要任务是征求意见、找准问题、分析原因、理清思路、明确方向。我们一定要按照上级要求，结合我院实际，扎实有效地做好第二阶段的各项工作，高标准、高质量地完成任务。分析检查阶段是整个学习实践科学发展观活动承上启下的关键阶段，要充分把握“三个环节”：一是要召开领导班子专题民主生活会。二是要形成领导班子分析检查报告。三是要认真组织群众评议。
胡秋林强调，在分析检查阶段一定要紧密联系实际、突出高校特点，力戒形式主义、务求取得实效。各党总支（支部）一定要充分认识分析检查阶段工作的重要性，算好时间点，理好发展帐，把好质量关，切实把分析检查工作做深做细做实。为此，一要加强领导。这次转段动员会后，各党总支（直属支部）主要负责同志要认真履行职责，亲自谋划，亲自部署，精心安排好每一个步骤、每一个环节，一个标准不能降，一个环节不能少，一个步骤不能缺，既要完成“规定动作”，又要创新“自选动作”。二要切实把握两个重点问题。院、系要紧扣科学发展主题，围绕两个主要目标，重点找准两方面的突出问题。三要着手解决突出问题。坚持边学边查边改，一方面切实解决影响和制约学院科学发展的突出问题以及群众反映强烈的突出问题，集中力量办几件群众看得见、摸得着、得实惠的实事。四要坚持统筹兼顾。目前已经到了5月下旬，离本学期结束还有不到两个月的时间。我们要以饱满的精神状态切实保证“两不误、两促进”。 要突出工作重点，合理分配时间，不断提高工作效率；要充分发挥党员的先锋模范作用，加班加点，甘于奉献，坚持以自己的实际行动来验证学习实践活动取得的成效。
院学习实践活动领导小组常务副组长兼办公室主任、党委副书记、纪委书记韩光辉强调指出，学习实践活动进入第二阶段后，并不意味着第一阶段学习调研工作的结束，大家要把学习调研工作作为长期的工作长抓不懈，继续营造浓厚的学习氛围。在分析检查阶段，要务必落实胡秋林书记的讲话精神，以求真务实的态度来对待学习实践活动，找准问题和症结所在并加以解决。广大党员干部要有强烈的使命感和责任感，发挥主动性，充分调动每位职工的积极性，为学院的建设发展献智出力。
当天的动员大会上，院学习实践活动领导小组第一副组长、院长张永生对分析检查阶段的具体日程安排作了详细的说明（具体情况见校园学习实践活动专题网）。